Nuestra compañera Carlota ha defendido su tesis doctoral en microbiología

Recientemente, Carlota Ruiz Gazulla de nuestro equipo “Ecología del Plancton y Retos Ambientales” defendió su tesis doctoral titulada ‘Ecology of marine aerobic anoxygenic phototrophic bacteria’. La tesis, que pertenece al programa de Doctorado de Microbiología de la ‘Universitat Autònoma de Barcelona’ (UAB), ha sido supervisada por la Dra. Olga Sánchez, de la UAB, el Dr. Josep M. Gasol del ‘Institut de Ciències del Mar’ (ICM-CSIC) y la Dra. Isabel Ferrera del Centro Oceanográfico de Málaga (IEO-CSIC), miembro también de nuestro grupo.

En su tesis, Carlota ha estudiado la diversidad y distribución de las AAP (del inglés, 'aerobic anoxygenic phototrophic bacteria') en ambientes marinos, usando muestras de las expediciones oceanográficas Malaspina y Poseidon así como del Observatorio Microbiano de la Bahía de Blanes.

  

Presentación de la tesis en el salón de actos del 'Institut de Ciències del Mar'

Conferencia Científica Anual de ICES 2023

La Conferencia Científica Anual del Consejo Internacional para la Exploración del Mar (ICES ASC, por sus siglas en inglés) se celebró en Bilbao del 11 al 14 de septiembre. Nuestra compañera Lidia Yebra presentó dos pósters y participó como delegada nacional en las reuniones del Comité Científico de ICES, que se celebran asociadas a la Conferencia.

Participantes del Instituto Español de Oceanografía
en la Conferencia posando en el Palacio Euskalduna (Bilbao)

Reunión final proyecto MICROZOO-ID

Esta semana hemos celebrado la reunión final del proyecto MICROZOO-ID, desarrollado desde octubre de 2021 a marzo de 2023. El proyecto, financiado por la Consejería de Economía, Innovación y Ciencia de la Junta de Andalucía y la Unión Europea (FEDER), ha sido coordinado por nuestra compañera Lidia Yebra y ha contado con la participación de varios miembros del grupo de Ecología del Plancton y Retos Ambientales, y con la colaboración de expertos en microplancton de Italia y Reino Unido.

El objetivo principal del proyecto MICROZOO-ID ha sido el desarrollo de un protocolo molecular para facilitar el estudio de las comunidades de microzooplancton en el Mar de Alborán.

Visita de las Licenciadas Aime Valle y Yeliany Martínez al C.O. Málaga

Durante la segunda quincena de junio, las Licenciadas Aime Valle y Yeliany Martínez, investigadoras del Centro de Estudios Ambientales de Cienfuegos (CEAC, Cuba) han realizado una estancia de formación en nuestro grupo gracias a una ayuda del proyecto internacional IWEco (Conservación y uso sostenible de la biodiversidad desde el enfoque de manejo integrado de cuencas y áreas costeras en Cuba). Este proyecto tiene como objetivo conservar, proteger y asegurar el uso sostenible de la diversidad biológica de Cuba en apoyo al desarrollo socio-económico del país, en beneficio de las generaciones actuales y futuras, y la rehabilitación de cuatro cuencas hidrográficas y sus ecosistemas costeros de las actividades antropogénicas más dañinas y los efectos del cambio climático. Por ello, la formación tanto práctica como teórica se ha centrado en el aprendizaje de diferentes técnicas metodológicas aplicadas al estudio de la eutrofización y la biodiversidad del microplancton marino.

 

 

El microplancton marino (organismos menores a 200 micras) tiene un papel central en los servicios ecosistémicos que proporcionan nuestros mares, y juega un papel muy importante en la red trófica marina, componiendo su base y siendo el punto de unión con niveles tróficos superiores. El cambio global y la actividad antropogénica están afectando a sus comunidades y al mantenimiento de los servicios ecosistémicos que proveen, dando lugar a importantes problemas que están impactando sectores relevantes de la actividad económica andaluza (proliferación de medusas, mareas rojas, eutrofización, disminución de pesquerías artesanales). Por tanto, el microplancton es un indicador clave en los programas de seguimiento impulsados por la legislación europea para garantizar el buen estado ambiental de nuestros mares (DMA, DMEM).

 

Aimee y Yeliany en el laboratorio de biología molecular, extrayendo ADN de muestras de microplancton

Comienza la nueva serie de las Fichas de Identificación de Plancton del ICES

En el post anterior, nuestro compañero Fran Gómez Jakobsen nos hablaba sobre una de las formas en que la oceanografía actual sigue avanzando en estos tiempos en los que no se puede salir al mar a trabajar. Hoy os mostramos un nuevo ejemplo de trabajo internacional que sigue adelante a pesar del confinamiento. 

Portada de la 2ª serie de Fichas de Identificación de Plancton del ICES. Imagen: Inês M. Dias and Lígia F. de Sousa para
 ICES Identification Leaflets for Plankton

En 1939 el ICES (Consejo Internacional para la Exploración del Mar) comenzó a publicar una serie de fichas de identificación de las principales especies de fitoplancton y zooplancton del Atlántico Norte elaboradas por expertos en los diferentes taxones y disponibles a la comunidad científica a través de su página web. Esta primera serie, cuenta con 186 fichas publicadas entre 1939 y 2001. Sin embargo, con la jubilación de su editor (Alistair Lindley) la serie quedó en pausa durante 18 años. En 2019, Antonina dos Santos (Instituto Portugués del Mar y la Atmósfera, IPMA) y Lidia Yebra, compañera del Laboratorio de Plancton (IEO) y pertenecientes al Grupo de Trabajo en Ecología de Zooplancton de ICES, retomaron su publicación como editoras de la nueva serie de Fichas de Identificación de Plancton de ICES. Estas fichas continúan viendo la luz en estos días en que el teletrabajo está más presente en nuestra labor científica. 

Reunión anual del WGEUROBUS en Peniche, Portugal.

El pasado mes de octubre (14 y 15) se celebró en Peniche (Portugal) la reunión anual del WGEUROBUS (Towards a EURopean OBservatory of the non-indigenous calanoid copepod Pseudodiaptomus marinUS). Se trata de un grupo de trabajo del ICES en el que se ha constituido un observatorio de la especie de copépodo no indígena Pseudodiaptomus marinus. 

Participantes en la reunión anual del WGEUROBUS en Peniche. 

Reunión anual de los grupos WGZE y WGPME del ICES

La semana pasada se reunieron los Grupos de Expertos en Ecología del Zooplancton (WGZE) y en Ecología del Fitoplancton y Plancton Microbiano (WGPME) del Consejo Internacional para la Exploración del Mar (ICES). En la reunión conjunta, organizada por IOCAG (ULPGC) en Las Palmas de Gran Canaria, participaron 50 investigadores de 15 países.

Miembros del WGZE asistentes a la reunión en el IOCAG

Visita de Elena Rey y Gelines Louro al Laboratorio de Plancton del C. O. Málaga

Siguiendo la línea de transferencia de tecnología que llevamos en el Laboratorio de Plancton, la semana pasada tuvimos una nueva visita. Elena Rey y Gelines Louro del C. O. la Coruña, se desplazaron hasta Fuengirola para conocer el funcionamiento del sistema de análisis de imagen de plancton que nosotros utilizamos.

Gelines Louro, Nerea Valcárcel y Elena Rey en el laboratorio de biología del C. O. Málaga.

1er Curso Avanzado de Taxonomía del Zooplancton (AZC1)

Desde el 22 de octubre hasta el 2 de noviembre, Nerea Valcárcel Pérez del Laboratorio de Plancton ha tenido la oportunidad de asistir al 1er curso Avanzado de Taxonomía del Zooplancton que se celebró en las instalaciones de la Estación Zoológica Anton Dohrn (Nápoles, Italia). La estación, que cuenta con casi 150 años de historia, es un instituto de investigación dedicado a la biología en varias de sus ramas, incluyendo la oceanografía.

Alumnos y parte del profesorado del AZC1 en la puerta del acuario de la Estación Zoológica Anton Dohrn. 

Análisis de imagen del plancton I: Introducción

Como os hemos contado en posts anteriores, este blog cumple una doble función, y una de ellas es la transferencia de tecnología, es decir, ofrecer asistencia técnica en la implantación de métodos de análisis de imagen del zooplancton. Pero...

 ¿Qué son los métodos de análisis de imagen?

Los métodos de análisis de imagen (en nuestro caso aplicados al zooplancton) consisten en un grupo de tecnologías que permiten la adquisición de imágenes procedentes de las muestras, la identificación de las partículas presentes en esas imágenes y la clasificación en grupos de cada partícula en diferentes grupos de interés.

Sistema de análisis de imagen utilizado en el Laboratorio de Plancton, compuesto por escáner Epson Photo
Perfection v700 Photo, ordenador de sobremesa y en pantalla, aplicación online de clasificación Ecotaxa. 

¿Por qué los utilizamos?

Durante las campañas oceanográficas el tiempo es oro, ya que debemos aprovechar la disponibilidad de barcos para realizar nuestro trabajo de campo. Es por ello que mientras estamos en el mar, recogemos todas las muestras posibles para luego tener trabajo que realizar en el laboratorio hasta que volvamos a tener la oportunidad de salir de nuevo a muestrear. Por ello, siempre que volvemos de una campaña lo hacemos con un montón de muestras que analizaremos en el laboratorio a lo largo de los siguientes meses. El recuento manual de organismos planctónicos es una labor que requiere mucho tiempo y una alta especialización en el caso de la identificación de los diferentes organismos a nivel de especies. Esto hace que los análisis sean lentos y que los análisis de plancton constituyan por lo general el cuello de botella en el desarrollo de los proyectos de investigación oceanográfica. Es por ello, que con el paso del tiempo y los avances tecnológicos se han ido desarrollando tecnologías, como el análisis de imagen, que facilitan este trabajo haciéndolo mucho más rápido.

Visita de Iñaki Franco al Laboratorio de Plancton del C. O. Málaga

Como anunciamos en el primer post, este blog cumple una doble función y una de ellas, es la de proporcionar apoyo a otros grupos de investigación para la implementación principalmente, de métodos de análisis de imagen del plancton. En este sentido, y en el contexto del proyecto Mar Menor en el que el Laboratorio de Plancton participa, hace unas semanas se desplazó hasta Fuengirola Ignacio Franco Navarro, Técnico de I+D+i del Centro Oceanográfico de Murcia.

Iñaki y Nerea en el laboratorio de biología del C. O. Málaga mientras Nerea le enseña la aplicación web Ecotaxa.

I Curso de Verano CEI·MAR ‘Mares de Andalucía'

Durante el pasado mes de julio, tuvo lugar el I Curso de Verano ‘Mares de Andalucía’a bordo del buque ‘UCADIZ’ en el que 24 estudiantes de universidades andaluzas, como premio a su brillante trayectoria académica, realizaron una campaña oceanográfica. Un viaje de diez días y unas 200 millas náuticas en la que los estudiantes seleccionados, en grupos de ocho, abordaron de forma práctica técnicas y métodos de trabajo en oceanografía física y biológica. La campaña se dividió en tres tramos: Motril-Málaga, Málaga -Algeciras y Algeciras-Cádiz, desde el 18 al 26 de julio de 2018, con tres días de navegación para cada tramo.

Participantes en la Campaña "Mares de Andalucía" a bordo del UCADIZ.
En la imagen aparecen alumnos, profesores y tripulación del buque. 

Introducción

El blog Laboratorio de Plancton, nace con el fin de prestar asistencia técnica en la identificación o implementación de métodos automáticos de análisis de imagen para el estudio del plancton, especialmente en el caso del zooplancton. 

Esta propuesta forma parte del proyecto con el cual Nerea Valcárcel Pérez obtuvo una ayuda para contratos de Personal Técnico de Apoyo en la convocatoria 2016 del Programa Estatal de Promoción del Talento y su Empleabilidad en I+D+i del Ministerio de Economía, Industria y Competitividad.

Nerea es la administradora del blog, y es especialista en el uso de métodos automáticos para el estudio de las comunidades planctónicas, habiendo profundizado además en la caracterización taxonómica tradicional de copépodos a nivel de especie. Actualmente se encuentra trabajando en la creación de los sets de entrenamientos necesarios para la identificación de muestras de mesozooplancton del Mediterráneo español. Esta página se concibe como una herramienta de transferencia de tecnología, a través de la cual Nerea podrá prestar apoyo técnico a las entidades que lo requieran, incluyendo la resolución de dudas taxonómicas mediante identificación de especímenes o el asesoramiento en la puesta a punto de equipamientos de análisis de imagen.

Además, el blog también pretende ser un canal divulgativo en el que se recogerá y dará difusión a la actividad investigadora que se realiza en el Laboratorio de Plancton del Centro Oceanográfico de Málaga, enmarcado dentro del grupo de investigación ECOALBORAN. Para ello en futuras publicaciones se irán dando a conocer las nuevas prestaciones del laboratorio así como los resultados más importantes de las actividades que se vayan desarrollando. Además a través de esta vía podrán resolverse también (por parte de Nerea o cualquier otro de los miembros del equipo de trabajo) las dudas que se planteen desde la comunidad científica, estudiantes o público en general. 

Esperamos que os resulte interesante la iniciativa y quedamos a vuestra disposición. 

Laboratorio de Plancton